Tutelle
Normandie Université, Inserm
Organisation
- Mr Thierry Frebourg; Assistante: Mme Nathalie Porchet
- 4 équipes :
- Prédisposition génétique au cancer, Thierry Frebourg
- Génomique et biomarqueurs des lymphomes et tumeurs solides, Fabrice Jardin
- Génétiques de la maladie d’Alzheimer, des démences et des psychoses, Dominique Campion
- Epigénétique et physiopathologie des anomalies du développement cérébral, Bruno Gonzalez
- 77 chercheurs, enseignants-chercheurs, ingénieurs, techniciens
- 26 doctorants, 14 étudiants M2
Axe(s) de recherche
- Cancers héréditaires associés aux mutations constitutionnelles de TP53
- Caractérisation des bases génétiques des cancers précoces par séquençage d’exomes
- Contribution des mutations d’épissage aux maladies humaines
- Immunothérapie personnalisée des formes héréditaires de cancer colo-rectal
- Caractérisation, par séquençage massif, des bases génétiques des lymphomes
- Développement et caractérisation, dans les hémopathies malignes et les tumeurs solides, de marqueurs personnalisés du cancer basés sur la détection de l’ADN tumoral circulant par PCR digitale et séquençage de nouvelle génération
- Caractérisation des bases génétiques de la maladie d’Alzheimer par séquençage d’exomes
- Modélisation de la maladie d’Alzheimer dans les cellules souches
- Développement dans la drosophile de modèles de démences neurodégénératives
- Caractérisation des altérations épigénétiques dues aux exposions anténatales et à l’origine des anomalies du développement cérébral
- Identification des facteurs de risque génétique conditionnant la survenue de lésions cérébrales chez l’enfant prématuré
Chiffres clés
Génomique, mutation, cancer, lymphomes, Alzheimer, démences, développement cérébral, séquençage nouvelle génération, risque, traitement
Equipements
- Plateformes de séquençage de nouvelle génération : Sonicateurs, robots d’extractions d’ADN et de préparation des librairies de NGS , 4 séquenceurs MiSeq et 2 séquenceurs NextSeq 500 (Illumina)
- Plate-forme d'hybridation génomique comparative sur puces (CGHarray).
- Séquenceurs automatiques capillaires
- Secteur L2 pour infection rétrovirale
- Plateau de transgenèse de drosophiles
Partenariats
La Fédération Hospitalo-Universitaire (FHU) «Centre Normand de Génomique Médicale et de Médecine Personnalisée» organisée autour de l’UMR 1245 et labellisée en 2015, regroupe les départements et laboratoires de génétique des CHU et CRLCC de Rouen et de Caen, les 2 plateformes de génomique de Rouen et de Caen, le Centre Normand de coordination de prise en charge des patients à haut risque génétique de cancer, le centre national de référence de la maladie d’Alzheimer du sujet jeune, l’unité Inserm U245, et la société rouennaise Inteactive Biosoftware spécialisée dans le développement et la commercialisation internationale de logiciels d’analyse génétique.
Informations complémentaires
L’Inserm U1245 "Genomic and Personalized Medicine in Cancer and Neurological disorders» créée en 2017 résulte de la fusion de 3 structures Inserm (Inserm U1079 ; Inserm U918 et Equipe Région-Inserm 28). L’Inserm U1245 est composée de quatre équipes respectivement focalisées sur (i) les formes héréditaires de cancer, (ii) la génomique des lymphomes et des tumeurs solides et le développement de marqueurs personnalisés du cancer, (iii) la génétique de la maladie d’Alzheimer et des démences et (iv) les bases épigénétiques des anomalies du développement cérébral. Elle regroupe 77 médecins, biologistes, chercheurs, ingénieurs et techniciens des Universités, CHU et CRLCC de Rouen et de Caen spécialisés en médecine génomique et assurant des les expertises complémentaires en clinique, génomique, biologie, bioinformatique et biostatistiques. L’objectif stratégique de l’Inserm U1245 est, dans le contexte du plan National Médecine Génomique 2025, de développer les nouveaux concepts et technologies en médecine génomique.
Principaux résultats obtenus - Description de la diversité du syndrome Li-Fraumeni du aux mutations du gène TP53
- Développement d’un nouvel essai fonctionnel des mutations du gène TP53 et d’un test universel de génotoxicité
- Caractérisation de l’hétérogénéité génétique des formes héréditaires de cancer du sein et de l’ovaire
- Contribution des mutations d’épissage aux formes héréditaires de cancer du colon, du sein et de l’ovaire
- Développement dans les cancers colo-rectaux avec instabilité microsatelllitaire d’une immunothérapie personnalisée basée sur des cellules présentatrices d’antigènes artificielles
- Caractérisation de l’hétérogénéité génétique des lymphomes et identification d’altérations causales dans la lymphomagenèse
- Mise au point dans les lymphomes de nouveaux outils diagnostiques permettant le séquençage rapide par NGS de panels de gènes et la détection de translocations
- Mise au point, dans les lymphomes et des tumeurs solides, de biopsies liquides basées sur la détection par PCR digitale de l’ADN tumoral circulant
- Démonstration du rôle, dans les formes précoces de la maladie d’Alzheimer, des variants rares de séquence et du nombre de copies des gènes du réseau du peptide Ab.
- Identification par séquençage d’exomes des bases moléculaires des démences avec calcifications primaires cérébrales
- Développement et caractérisation dans des modèles de drosophiles des protéinopathies TDP-43
- Démonstration de spécificité des microvaisseaux cérébraux chez le nouveau-né
- Démonstration de l’impact de l’exposition anténatale à l’alcool sur l’angiogenèse corticale
- Caractérisation du rapport bénéfice/risque des différents anesthésiques sur le cerveau en développement
- Le traitement par le sulfate de magnésium chez la femme enceinte n’a pas d’effet délétère à long terme sur le développement cérébral
- Les taux de PLGF dans le placenta sont des marqueurs prédictifs de l’atteinte cérébrale fœtale après exposition à l’alcool